Los permisos de funcionamiento se clasifican en tres grupos según su riesgo sanitario y ambiental:
Grupo A: Riesgo alto
Grupo B: Riesgo moderado
Grupo C: Riesgo bajo
El costo del permiso sanitario de funcionamiento en Costa Rica depende de la clasificación de riesgo de la actividad comercial:
Clase riesgo tipo A: $100
Clase riesgo tipo B: $50
Clase riesgo tipo C: $30

Los tramites son en el Ministerio de Salud de Costa Rica